В первый российский чемпионат 1992-го года краснодарская «Кубань» вступила в статусе команды высшей лиги. Правда, задержаться в элите надолго у южан не получилось. Мало того, в следующем сезоне «Кубань» транзитом через первую лигу проследовала еще ниже…

Возвращение клуба во второй эшелон нашего футбола состоялось в 1995-м году, когда кубанцы выиграли путевку наверх. Однако для серьезных свершений на уровне первой лиги «Кубани» тех лет определенно не хватало стабильных финансовых вливаний.

Кончилось дело тем, что в 1998-м году «Кубань» логично выбыла из числа участников турнира. В 1999-м году назначенный на пост главного тренера краснодарцев Софербий Ешугов должен был поспособствовать возращению команды в первый дивизион. Но, выиграв первенство в зоне «Юг», «Кубань» уступила в переходном турнире. Впрочем, в следующем сезоне (2000 г.) кубанцы уверенно опередили всех соперников, тем самым официально оформив свой долгожданный выход в Первый дивизион.

Усилившись в межсезонье весьма квалифицированными мастерами, «Кубань» сразу на равных повела спор с признанными лидерами дивизиона. Третье место стало несомненным успехом.

В 2003-м году упорно рвущаяся в элиту «Кубань» очень хорошо стартовала, но в середине лета угодила в«яму», стоившую потери важнейших очков. Последовавшие тут же оргвыводы краевых властей «встряхнули» клуб. С новым главным тренером Николаем Южаниным «Кубань» выдала внушительную победную серию и выполнила главную задачу.

Готовность краснодарцев к выступлению Премьер-лиге оценивалась их руководством довольно высоко. Но после ряда неудач «Кубань», несмотря на отдельные запоминающиеся игры, вернулась в первый дивизион.

В новый поход за путевкой в Премьер-лигу клуб повел иностранный специалист Йозеф Хованец. Чешский наставник, прежде всего, позаботился о защитной линии всегда достаточно пропускавшей «Кубани», однако кубанцам явно не хватало созидателей, и забивал клуб для одного из лидеров первого дивизиона непростительно редко. Задача выхода в Премьер-лигу автоматически перенеслась на следующий год.

В межсезонье на капитанском мостике краснодарского клуба оказался Павел Яковенко. Украинский наставник ожидаемо подтянул команде дисциплину и стал инициатором приглашения в «Кубань» целой группы молодых мастеров. Итоговый результат краснодарцев ни для кого не оказался сюрпризом – они легко и непринужденно добились права начать сезон-2007 в Премьер-лиге.

Но отрицательный опыт 2004-го года не стал уроком для владельцев и руководства клуба. Краснодарцы вновь неважно стартовали, однако это вполне объяснялось запредельными физическими нагрузками, предложенными главным тренером на сборах.

Попытка удержать команду в Премьер-лиге с помощью активно проведенной дозаявочной кампании успехом не увенчалась, и «Кубань» вновь отправилась по уже знакомому маршруту. К сезону-2008 «Кубань» готовил Александр Тарханов, однако уже после первых двух туров Первого дивизиона, в которых краснодарцы очками разжиться так и не сумели, на пост главного тренера был назначен Сергей Павлов, имеющий богатый опыт вывода команд в элиту российского футбола. При Павлове команда моментально преобразилась и сумела догнать оторвавшихся было лидеров.